Com a mudança no regulamento, a Copa do Nordeste não terá clássicos estaduais na primeira fase, como acontecia nas edições anteriores. Após cobrança de alguns clubes, a CBF mudou o formato de disputa, e agora os oito times do Grupo A se enfrentam entre si na primeira fase. O mesmo aconteceu para o Grupo B.
Para a realização do sorteio, os 16 clubes serão ordenados em potes numerados de 1 a 4. No Pote 1, estarão os melhores ranqueados no Ranking Nacional de Clubes 2024 (RNC) e assim sucessivamente até o Pote 4. Dois clubes de cada pote irão para os Grupos A e B. O primeiro sorteado do Pote 1 será alocado no Grupo A, enquanto o segundo sorteado do Pote 1 será no alocado no Grupo B. Este será o processo até o último clube de cada pote. Há, porém, algumas exceções.
Dois clubes com melhor posicionamento no RNC dentro de cada Federação deverão estar em grupos distintos. No momento em que for sorteado o clube cujo Estado tiver mais de um representante, o outro clube será alocado imediatamente no grupo oposto, antes de ser sorteado. Com isso, Bahia e Vitória ficarão em grupos diferentes e só podem se enfrentar no mata-mata.
As Federações Bahiana e Cearense contam com três representantes cada. Por isso, assim que o primeiro time for sorteado, o melhor ranqueado entre os outros dois será alocado em um grupo oposto. O terceiro clube poderá ser sorteado para qualquer grupo.
O sorteio será realizado na próxima terça-feira (14), no Rio de Janeiro, às 20h. Ferroviário-CE, Juazeirense-BA, CSA-AL e Moto Club-MA se classificaram na fase preliminar e se juntaram a Altos-PI, América-RN, Ceará, Confiança-SE, CRB-AL, Sousa-PB, Sport, Vitória, Sampaio Corrêa-MA, Bahia, Fortaleza e Náutico.
